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清華長(zhǎng)庚醫(yī)院與水木分子攜手,行業(yè)首創(chuàng)利用生物醫(yī)藥多模態(tài)大模型助力藥物心臟安全性評(píng)價(jià)體系建立與驗(yàn)證

2024-11-29 18:08:30來(lái)源:藥方舟瀏覽量:340

日前,清華大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院(北京清華長(zhǎng)庚醫(yī)院,簡(jiǎn)稱(chēng)清華長(zhǎng)庚)與創(chuàng)新型AI公司北京水木分子生物科技有限公司(簡(jiǎn)稱(chēng)水木分子)宣布攜手合作,將利用水木分子全球領(lǐng)先的生物醫(yī)藥多模態(tài)大模型技術(shù),助力藥物心臟安全性評(píng)價(jià)體系建立與驗(yàn)證。該合作項(xiàng)目獲得北京市自然科學(xué)基金——重點(diǎn)研究專(zhuān)題項(xiàng)目基金支持。

心臟安全性是新藥研發(fā)、審批與臨床應(yīng)用過(guò)程中重要的評(píng)價(jià)因素。心血管相關(guān)的負(fù)面影響是導(dǎo)致約45%已批準(zhǔn)藥物被撤回以及30%藥物損耗的主要原因。在所有藥物心臟毒性中,最常見(jiàn)的是尖端扭轉(zhuǎn)性室性心動(dòng)過(guò)速(QdP),而QT間歇延長(zhǎng)是導(dǎo)致QdP主要因素之一。因此,研究QT間歇延長(zhǎng)對(duì)藥物的心臟安全性的評(píng)估至關(guān)重要。

此次合作,基于長(zhǎng)庚醫(yī)院多年積累的寶貴的脫敏臨床QT-心臟毒性數(shù)據(jù),采用水木分子全球前沿的生物醫(yī)藥多模態(tài)大模型技術(shù),開(kāi)創(chuàng)性地構(gòu)建科學(xué)、有效的藥物心臟安全性評(píng)價(jià)體系,對(duì)于提高藥物研發(fā)成功率,助力醫(yī)院和監(jiān)管機(jī)構(gòu)安全性評(píng)價(jià)的精準(zhǔn)用藥、提供高風(fēng)險(xiǎn)病患用藥安全保障,具有重要的社會(huì)意義和商業(yè)價(jià)值。


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生物醫(yī)藥多模態(tài)大模型助力

藥物心臟安全性評(píng)價(jià)體系建立與驗(yàn)證項(xiàng)目啟動(dòng)


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生物醫(yī)藥多模態(tài)大模型助力

藥物心臟安全性評(píng)價(jià)體系建立與驗(yàn)證項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)合影



此研究項(xiàng)目將惠及患者、醫(yī)院、監(jiān)管機(jī)構(gòu)和新藥創(chuàng)新企業(yè)多方。研究項(xiàng)目將包含兩個(gè)方向:


第一,建立針對(duì)已上市藥物心臟毒性臨床預(yù)警大模型:當(dāng)藥物投放市場(chǎng)后在更廣泛人群用藥時(shí),借助模型對(duì)特定人群的藥物心臟毒性進(jìn)行預(yù)警,醫(yī)生可通過(guò)使用穿戴設(shè)備等方式及時(shí)介入干預(yù)。監(jiān)管機(jī)構(gòu)則可以對(duì)不良反應(yīng)持續(xù)監(jiān)測(cè)。該預(yù)警模型助力醫(yī)院和監(jiān)管機(jī)構(gòu),更有效地在真實(shí)世界藥物使用中避免患者的用藥風(fēng)險(xiǎn)。


第二,針對(duì)開(kāi)發(fā)中的新藥分子的心臟毒性預(yù)測(cè)模型:主要面向創(chuàng)新藥企,針對(duì)未上市新藥,建立體外hERG及體內(nèi)QT及臨床心臟毒性的相關(guān)性,模型可在藥物研發(fā)的早期預(yù)測(cè)藥物的心臟毒性,提高研發(fā)的成功性,避免浪費(fèi)寶貴的資源。


當(dāng)前藥物心臟安全性評(píng)價(jià)的三大挑戰(zhàn)包括:缺乏高質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)化的數(shù)據(jù);數(shù)據(jù)存在孤島、數(shù)據(jù)整合能力低;研究評(píng)價(jià)體系及標(biāo)準(zhǔn)尚待建立與完善。清華長(zhǎng)庚和水木分子聯(lián)合,將針對(duì)這些挑戰(zhàn),首先建立心臟毒性的多維度、多模態(tài)、多中心的臨床大數(shù)據(jù)平臺(tái)。建立藥物心臟安全性評(píng)價(jià)預(yù)警及預(yù)測(cè)大模型過(guò)程中,在多中心進(jìn)行驗(yàn)證及優(yōu)化,最后確立預(yù)警及預(yù)測(cè)的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)。


北京清華長(zhǎng)庚醫(yī)院副院長(zhǎng)、心血管中心主任,清華大學(xué)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究院副院長(zhǎng)張萍教授表示,“清華長(zhǎng)庚歷經(jīng)十年的精心積累和精細(xì)化治理。已建立了遺傳性心律失常、心肌病、猝死生還者標(biāo)準(zhǔn)化診療體系和數(shù)據(jù)庫(kù),并做了諸多創(chuàng)新性工作,為此榮獲2023年華夏科學(xué)技術(shù)進(jìn)步二等獎(jiǎng)。


我作為項(xiàng)目負(fù)責(zé)人,同時(shí)也是中華醫(yī)學(xué)會(huì)心血管病學(xué)分會(huì)信息化學(xué)組組長(zhǎng),近年致力于心血管疾病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)的AI研究和基于QT間期延長(zhǎng)的心臟安全性評(píng)價(jià)研究,努力實(shí)現(xiàn)研究突破。


水木分子是生物醫(yī)藥領(lǐng)域國(guó)際最前沿的垂類(lèi)大模型公司。清華長(zhǎng)庚和水木分子的合作是強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合。此次聯(lián)合研究將采用多種高質(zhì)量醫(yī)療數(shù)據(jù),包括:人口學(xué)、化驗(yàn)、心電圖、遺傳、環(huán)境、分子生物學(xué)、藥物化學(xué)數(shù)據(jù),涉及包括文本、分子結(jié)構(gòu)、心電圖等多模態(tài),從而跨模態(tài)數(shù)據(jù)分析難度極大。因此,我們需要聯(lián)合水木分子,并采用業(yè)界最前沿的千億參數(shù)生物醫(yī)藥多模態(tài)大模型技術(shù),共同研發(fā)心臟毒性預(yù)警和預(yù)測(cè)模型,這將極大助力心臟安全性評(píng)價(jià)的精準(zhǔn)決策。


我們的未來(lái)技術(shù)路線是支持配合心臟安全性評(píng)價(jià)體系建立多中心驗(yàn)證,利用交叉學(xué)科的巨大能量,引領(lǐng)臨床和科研的前沿突破。”


清華大學(xué)國(guó)強(qiáng)教授、AIR首席研究員、十四五國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃“新藥研發(fā)大模型”課題負(fù)責(zé)人,水木分子首席科學(xué)家聶再清博士說(shuō):“醫(yī)藥行業(yè)雖然已經(jīng)存在大量數(shù)據(jù),但是這些數(shù)據(jù)有結(jié)構(gòu)化、非結(jié)構(gòu)化,有文本、表格、圖片等常規(guī)數(shù)據(jù)形式,也有SMILES、序列、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)等化學(xué)、生物語(yǔ)言。因此數(shù)據(jù)的多模態(tài)融合是一大挑戰(zhàn)。為了解決這一問(wèn)題,我們與‘醫(yī)藥老法師’一同嚴(yán)格篩選數(shù)據(jù)源,構(gòu)建大模型和數(shù)據(jù)專(zhuān)家人機(jī)交互的標(biāo)注方式,以確保數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和準(zhǔn)確性,從而為大模型高效精準(zhǔn)地學(xué)習(xí)生物醫(yī)藥垂類(lèi)知識(shí)提供了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。


水木分子率先研發(fā)了千億參數(shù)多模態(tài)大模型ChatDDFM?,新增了一個(gè)將自然語(yǔ)言和生物編碼語(yǔ)言‘對(duì)齊’的環(huán)節(jié),可以將多種來(lái)源、標(biāo)準(zhǔn)、模態(tài)的數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)起來(lái),結(jié)合知識(shí)圖譜,可以更廣泛、更深刻地挖掘出多模態(tài)大數(shù)據(jù)的內(nèi)在價(jià)值。專(zhuān)家甚至可以用自然語(yǔ)言提問(wèn),‘幫我再優(yōu)化一下這個(gè)分子,預(yù)測(cè)一下毒性’,模型會(huì)反饋它的結(jié)果和專(zhuān)業(yè)性建議。


清華長(zhǎng)庚和水木分子都堅(jiān)定地站在生物醫(yī)藥與人工智能的交匯點(diǎn),我們堅(jiān)信大模型助力心臟安全性評(píng)價(jià)前瞻性研究將對(duì)產(chǎn)業(yè)和廣大患者極具深遠(yuǎn)意義。水木分子也會(huì)持續(xù)投入兼具社會(huì)價(jià)值和商業(yè)意義的項(xiàng)目,通過(guò)矢志不渝的技術(shù)創(chuàng)新,助力人類(lèi)健康福祉”。


水木分子聯(lián)席首席科學(xué)家李秀艷博士說(shuō):“清華長(zhǎng)庚和水木分子本次合作是一個(gè)利用大模型助力解決醫(yī)藥研發(fā)及臨床實(shí)踐中未被滿足的需求的高價(jià)值項(xiàng)目。2023年7月底開(kāi)始實(shí)施的ICH《E14非抗心律市場(chǎng)要職QT/QTc間期延長(zhǎng)及潛在致心律失常作用的臨床評(píng)價(jià)指導(dǎo)原則》(以下簡(jiǎn)稱(chēng)ICH E14), 以及《S7B:人用藥物延遲心室復(fù)極化(QT間期延長(zhǎng))潛在作用的非臨床評(píng)價(jià)指導(dǎo)原則》,開(kāi)啟了藥物心臟毒性研究的新時(shí)代。


水木分子在進(jìn)入ChatDD大模型技術(shù)賦能臨床服務(wù)的新階段(Super-Charged 臨床CRO)與擁有多年臨床研究和新藥研究經(jīng)驗(yàn)的張萍副院長(zhǎng)及清華長(zhǎng)庚團(tuán)隊(duì)在這個(gè)重要的領(lǐng)域合作是絕佳的機(jī)會(huì)。雙方團(tuán)隊(duì)擁有醫(yī)學(xué)、臨床研究、藥物化學(xué)、大模型、數(shù)據(jù)及統(tǒng)計(jì)學(xué)專(zhuān)家,具備開(kāi)發(fā)此創(chuàng)新心臟毒性預(yù)警和預(yù)測(cè)大模型的完整能力,此模型可以填補(bǔ)行業(yè)在心臟毒性預(yù)測(cè)方面的空白。我們期待這個(gè)模型的成功開(kāi)發(fā),并期待將它用于支持我們?nèi)虻纳贽k方伙伴的臨床前及臨床研究中,提高新藥研發(fā)的效率和成功率”。


關(guān)于北京清華長(zhǎng)庚醫(yī)院:

清華大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院(北京清華長(zhǎng)庚醫(yī)院,簡(jiǎn)稱(chēng)清華長(zhǎng)庚)是一家三級(jí)公立、教學(xué)研究型綜合醫(yī)院,規(guī)劃床位1500張,設(shè)有七大部及51個(gè)專(zhuān)科。醫(yī)院連續(xù)多年在國(guó)家績(jī)效考核中表現(xiàn)優(yōu)異,榮獲A+等級(jí),并在2020年醫(yī)療質(zhì)量運(yùn)營(yíng)水平評(píng)估中位列市屬醫(yī)院前茅。作為智慧健聯(lián)體北京市工程中心及中國(guó)醫(yī)師協(xié)會(huì)智慧醫(yī)療專(zhuān)委會(huì)主席單位,醫(yī)院創(chuàng)建了清華大學(xué)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究院和清華大學(xué)智慧醫(yī)療研究院,展現(xiàn)了強(qiáng)大的醫(yī)工結(jié)合創(chuàng)新能力。

醫(yī)院依托清華大學(xué)的理工資源,成為醫(yī)工結(jié)合技術(shù)攻關(guān)和創(chuàng)新轉(zhuǎn)化的重要基地,吸引了包括國(guó)家工程院院士在內(nèi)的眾多高層次人才。在智慧醫(yī)療領(lǐng)域,醫(yī)院構(gòu)建了清華數(shù)智健康醫(yī)療中心,運(yùn)用人工智能、大數(shù)據(jù)、云計(jì)算等先進(jìn)技術(shù),打造智慧健康醫(yī)療運(yùn)營(yíng)平臺(tái),實(shí)現(xiàn)分級(jí)診療、多級(jí)聯(lián)動(dòng)和雙向轉(zhuǎn)診。

此外,醫(yī)院在心電數(shù)據(jù)挖掘和預(yù)測(cè)方面具備領(lǐng)先實(shí)力,牽頭依托工信部與藥監(jiān)局“揭榜掛帥”項(xiàng)目建立了中國(guó)首個(gè)基于可穿戴式設(shè)備的心血管疾病相關(guān)生理參數(shù)標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫(kù)”、成立了中國(guó)MUSE心電數(shù)據(jù)庫(kù)聯(lián)盟,與全國(guó)150家醫(yī)院攜手合作。醫(yī)院還積極開(kāi)展多學(xué)科聯(lián)合診療,深入踐行“精準(zhǔn)醫(yī)療、精誠(chéng)服務(wù)、精益管理”的三精醫(yī)療理念,為患者提供高質(zhì)量的醫(yī)療服務(wù)。同時(shí),國(guó)際醫(yī)療中心也為國(guó)內(nèi)外各界人士提供全面、精湛的醫(yī)療服務(wù)。

清華長(zhǎng)庚醫(yī)院副院長(zhǎng)張萍教授:

張萍教授是清華大學(xué)臨床長(zhǎng)聘教授、主任醫(yī)師、博士生導(dǎo)師,北京清華長(zhǎng)庚醫(yī)院副院長(zhǎng)、心血管中心主任,清華大學(xué)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究院副院長(zhǎng)。擅長(zhǎng)各類(lèi)心律失常及各類(lèi)疑難危重心血管疾病診治,在暈厥猝死防治、及遺傳性心律失常診治方面居國(guó)內(nèi)領(lǐng)先水平。

同時(shí),張萍教授還擔(dān)任了中國(guó)老年保健醫(yī)學(xué)研究會(huì)數(shù)智健康委員會(huì)主任委員、中華醫(yī)學(xué)會(huì)心血管病分會(huì)委員兼信息學(xué)組組長(zhǎng)、中國(guó)醫(yī)師協(xié)會(huì)心血管醫(yī)師分會(huì)常委、中國(guó)生物工程學(xué)會(huì)心律學(xué)分會(huì)副主任委員、中國(guó)醫(yī)師協(xié)會(huì)心力衰竭工作委員會(huì)副主任委員、海峽兩岸醫(yī)藥技術(shù)交流協(xié)會(huì)心血管病分會(huì)副主任委員、北京醫(yī)學(xué)會(huì)心血管病分會(huì)副主任委員等等;兼任《中國(guó)畢業(yè)后醫(yī)學(xué)教育雜志》執(zhí)行主編、《ESC cardiovascular》副主編、《PACE》、《Cardiology Discovery》《中華心血管病雜志》、《中華心律失常雜志》、《中國(guó)起搏與電生理雜志》、《中華心力衰竭與心肌病雜志(電子版)》、《中華老年多器官雜志》等編委。享受?chē)?guó)務(wù)院政府特殊津貼。

關(guān)于水木分子:

水木分子專(zhuān)注開(kāi)發(fā)垂于生物醫(yī)藥的AI大模型,由清華大學(xué)人工智能產(chǎn)業(yè)研究院(AIR)孵化。清華大學(xué)國(guó)強(qiáng)教授、AIR首席研究員聶再清教授擔(dān)任首席科學(xué)家。水木分子致力于打造生物醫(yī)藥行業(yè)的基礎(chǔ)大模型及新一代對(duì)話式藥物研發(fā)助手ChatDD。

ChatDD基于水木分子千億參數(shù)多模態(tài)生物醫(yī)藥對(duì)話大模型底座 ChatDDFM?,具備專(zhuān)業(yè)知識(shí)力、認(rèn)知探索力和工具調(diào)用能力。作為生物醫(yī)藥研發(fā)助手ChatDD旨在于服務(wù)醫(yī)藥研發(fā)全流程場(chǎng)景,從立項(xiàng)調(diào)研,早期藥物發(fā)現(xiàn),臨床前研究到臨床試驗(yàn)、藥物重定位等各環(huán)節(jié)。

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水木分子首席科學(xué)聶再清博士:

聶再清博士,現(xiàn)任清華大學(xué)國(guó)強(qiáng)教授和AIR首席研究員、十四五科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃新藥研發(fā)大模型課題負(fù)責(zé)人,以及水木分子首席科學(xué)家。帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)研發(fā)并且開(kāi)源了全球首個(gè)多模態(tài)生物醫(yī)藥大模型BioMedGPT和OpenBioMed工具包,賦能生物醫(yī)藥行業(yè)科研和創(chuàng)新。聶再清博士2004年獲得美國(guó)亞利桑那州立大學(xué)博士學(xué)位,本科和碩士畢業(yè)于清華大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)系。2017年加入阿里巴巴,任達(dá)摩院人工智能實(shí)驗(yàn)室北京負(fù)責(zé)人和天貓精靈首席科學(xué)家。此前就職于微軟亞洲研究院,任首席研究員。是微軟學(xué)術(shù)搜索和人立方的發(fā)起人和負(fù)責(zé)人,也是微軟自然語(yǔ)言理解平臺(tái)LUIS的技術(shù)負(fù)責(zé)人。2019年他所帶領(lǐng)的團(tuán)隊(duì)獲得了吳文俊人工智能科技進(jìn)步獎(jiǎng)。

水木分子聯(lián)席首席科學(xué)家李秀艷博士:

李秀艷博士于1981-1989年就讀于北京大學(xué)化學(xué)系,博士畢業(yè)于美國(guó)康州大學(xué)藥學(xué)院,擁有三十余年全球藥物研發(fā)、創(chuàng)新技術(shù)應(yīng)用、國(guó)際國(guó)內(nèi)資源整合、跨境合作的實(shí)操經(jīng)驗(yàn),曾任美國(guó)強(qiáng)生外部創(chuàng)新負(fù)責(zé)人,藥明康德產(chǎn)品開(kāi)發(fā)服務(wù)副總裁。她有著深厚的藥物研發(fā)一線經(jīng)驗(yàn)及敏銳的技術(shù)和市場(chǎng)潛力的判斷能力。曾經(jīng)領(lǐng)導(dǎo)或參與了強(qiáng)生兩百多個(gè)外部合作伙伴的遴選,價(jià)值10億美金的外部合作項(xiàng)目的立項(xiàng)、盡調(diào)和合同洽談。

李秀艷博士還活躍于中國(guó)醫(yī)藥行業(yè)國(guó)際化及國(guó)內(nèi)外商業(yè)開(kāi)拓(BD)的前沿,曾與政府、基金、企業(yè)協(xié)力引進(jìn)高質(zhì)量國(guó)際項(xiàng)目。

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